Nukenin (抜け忍, nukenin, TV Brasileira: Ninja Patife; Literalmente significa "Ninja Fugitivo") são shinobi que deixaram suas aldeias sem a intenção de voltar e que cortaram os laços com esta, muitas vezes porque eles cometeram atos criminosos ou para conseguir outros ganhos pessoais. A aldeia ninja da qual eles são vai frequentemente tentar encontrá-los e eliminá-los. Vários nukenin não pararam de usar seus protetores de testa, enquanto outros podem tê-los descartado. Os membros da Akatsuki que ainda usam seus protetores entalharam um longo risco horizontal sobre o símbolo, para mostrar que eles rescindiram suas alianças e rejeitaram suas aldeias. Kirigakure tem uma força-tarefa especial de oinins, cujo único objetivo é matar ninjas traidores. Isto não é feito somente como uma punição pela traição, mas também para proteger os segredos da aldeia, uma vez que é possível aprender algumas das técnicas da aldeia através de autópsia dos usuários.[1] A organização ninja Akatsuki era composta em sua maioria por nukenin Rank-S, exceto por Nagato e Konan, que eram os líderes de Amegakure. A maioria dos nukenin ao longo da série são antagonistas.